Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms