Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Itsn2Q9Z0R6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itsn2Q9Z0R6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms