Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms