Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms