Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Stub1Q9WUD1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stub1Q9WUD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms