Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6cQ9WTM3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms