Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam50bQ9WTJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam50bQ9WTJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms