Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf7Q9R1C0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms