Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms