Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NumbQ9QZS3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NumbQ9QZS3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms