Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf4Q9QZS2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms