Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms