Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Rdh11Q9QYF1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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