Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms