Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg2Q9QXK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms