Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms