Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trp53inp1Q9QXE4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms