Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc5Q9QX29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc5Q9QX29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms