Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdcQ9QW08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdcQ9QW08 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms