Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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