Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms