Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms