Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rabgef1Q9JM13 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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