Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms