Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod4Q9JLH8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tmod4Q9JLH8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Tmod4Q9JLH8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Tmod4Q9JLH8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms