Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tlr5Q9JLF7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tlr5Q9JLF7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms