Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Habp4Q9JKS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Habp4Q9JKS5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms