Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole3Q9JKP7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole3Q9JKP7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms