Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms