Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem3Q9JKE1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms