Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms