Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms