Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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