Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip3Q9JJR9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms