Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr12Q9JJA4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr12Q9JJA4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms