Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms