Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc22Q9JIG7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms