Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms