Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms