Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms