Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp2Q9EPK2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms