Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bap18Q9DCT6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bap18Q9DCT6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bap18Q9DCT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms