Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms