Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufa8Q9DCJ5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms