Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pak1ip1Q9DCE5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pak1ip1Q9DCE5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pak1ip1Q9DCE5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pak1ip1Q9DCE5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1ip1Q9DCE5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms