Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms