Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms