Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms