Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms