Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms